Las proteínas en los rumiantes: de boca hacia dentro.

Las proteínas son el lenguaje construido con aminoácidos, un alfabeto de 20 sustancias que construye millones y millones de palabras. Las proteínas son ingeridas y degradadas (catabolismo), y luego forman nuevas moléculas nitrogenadas. ¿Quién y cómo hace esa chamba? El artículo "Los ácidos grasos volátiles, fuente de energía en los rumiantes" ofrece una buena perspectiva de ese ir y venir. Si te interesa ir más allá, el artículo "Degradation of protein in the rumen of the sheep" ofrece una mirada más profunda del tema.

La energía no sea crea ni se destruye, pero... ¿de dónde se obtiene?

Cuando pensamos de dónde obtenemos la energía para un proceso agropecuario pensamos en primer lugar en el Sol como la fuente eterna. Después, quizá los alimentos o los combustibles, la energía eléctrica. ¿Qué otra fuente aporta energía al sistema de producción? He aquí un acercamiento bastante interesante al uso de energía en la agricultura.

Enzimas: El primer acercamiento

Los seres vivos somos una máquina de consumo de energía. A no ser por las enzimas, seríamos seres terriblemente insostenibles. Estas proteínas ayudan a disminuir y optimizar el gasto energético de los organismos vivos. ¿Te suena esto? En momentos de crisis energéticas mundiales, inestabilidad en el precio de los hidrocarburos y derroche energético exacerbado por el consumo estas moléculas nos hablan de eficiencia. Échale ojo a sus principios básicos.

¿De qué estamos hechos?

Todos lo sabemos: sangre, sudor y lágrimas. Y carnes y grasa, cabello y piel. Y algunas cosas poco decorosas. ¿Y qué más? Agua, proteínas, azúcares, grasas y genes. O sea: lo mismo pero en otras palabras. El Departamento de Bioquímica y Biofísica Molecular de la Universidad de Arizona ofrece el Biology Project, una colección de recursos para conocer de qué estamos hechos. (Algunas secciones están en español, para quienes temen el inglés.)

Talking about (soil) conservation

What is the relation between soil erosion and conservation and climate change? And how about best management practices (BMP)? How can water erosion be predicted? Is the soil a living or a no-living thing? A blog about soil conservation? Please click here and take a look at "science, policy and practice of soil and water conservation for sustainability", with case studies all around the world.

Ladrón que roba ladrones

¿Qué tan cierto será lo de "ladrón que roba ladrón"? La historia está más o menos así: un tipo lleva cuarenta años en el trajín, ha sustraído pertenencias de las casas de gente como Luis Echeverría y José López Portillo (ex-presidentes) o Hugo Sánchez (el mismo Hugol). Hasta participó en un documental más o menos famoso. ¿Quieres saber más? Entrale al link. Una noticia de sección policiaca que bien puede caber en sociales, cine, humor, literatura, etc.

¿Universo interior?

¿Alguien quiere echar un vistazo al universo que todos llevamos dentro? MolecularMovies.org es un portal con animaciones del interior de las células (eucariotas, bacterias, virus) y algunas macromoléculas, procesos celulares y moleculares, entre otros temas. Algunos videos tienen explicaciones en inglés, pero las imágenes muchas veces hablan por sí solas. Espero sea de utilidad.  

Acercamiento a la cyberbioquímica

En el cruce de caminos entre la ruta de la bioquímica y la informática he encontrado este rincón (click en el título de la entrada), especie de parador a mitad de viaje, para tomar un refresco y echarle ojo a algunas opciones para ampliar nuestro conocimiento de bioquímica, ayudado por artículos, animaciones, películas y dos o tres herramientas más. Entre las opciones hay una pequeña nota: 20 aminoácidos distintos ¿o son más?, donde cuestiona lo que afirmamos en clases: son 20 los aminoácidos que forman parte de las proteínas.

Aminoácidos: El alfabeto de las proteínas

Si las proteínas constituyen el lenguaje con el que está formada una buena parte de nuestra materia viva, los aminoácidos constituyen el alfabeto de dicho lenguaje. ¿Qué son y cómo son? La oferta en Internet es bastante amplia: aquí dejo una liga al Depto de Bioquímica de la Fac. de Química de la UNAM. Recomendable para repasar conceptos básicos.

Definición estadística

Una buena definición de estadística (de Said Infante, creo) dice que es la diferencia entre lo que es y lo que uno quiere que sea. Entre que sí o que no, entre que si la talacha o la ciencia, que si el abstracto lenguaje matemático y lo que los experimentos nos dicen, dejo un enlace a un muy buen libro electrónico sobre el tema. Está en inglés, pero creo que es (en términos del idioma, que no del lenguaje) bastante accesible. 

¿Especie = ecosistema?

¿Qué es un ecosistema? Una definición clásica diría que es un conjunto de especies (medio biótico) que interactúan con su entorno (medio abiótico). Esto se traduce en una compleja trama de relaciones, en las que la energía y los materiales se extraen del entorno, fluyen entre los distintos componentes y regresan transformados al medio. Pero... ¿y si el ecosistema está formado por una única especie? ¿Será posible eso? Échale ojo a este noticia de la BBC.

Ciclos biogeoquímicos

Al establecer un cultivo extraemos del entorno carbono, oxígeno, nitrógeno, fósforo y minerales. Para garantizar este cultivo a mediano o largo plazo tendríamos que procurar el retorno de estos elementos al medio: ¿cómo conseguirlo? El conocimiento de los ciclos biogeoquímicos nos permite entender cómo y por qué. Da click al título de la entrada y disfruta de una alternativa de información virtual, con datos y animaciones. (Nota: Hay varios errores de edición en la página, pero la información es confiable).  

Información para el curso de Bioquímica

En la plataforma eminus de la UV podrán encontrar materiales (archivos, enlaces, etc.) para el curso de Bioquímica que imparto en la FISPA. ¿Cómo entrar? El usuario es cada uno de ustedes: tendrán que anotar su matrícula (ZS + los dígitos de su matrícula) y en la contraseña anoten su RFC (cuatro letras + seis números). Los materiales están en el curso Bioquímica (clave 8516). Para entrar, dale click en el título de esta entrada. Buen provecho. 

¿Cómo son las proteínas?

Alguna vez uno de mis alumnos me preguntó cómo era una proteína. De repente no supe cómo describirla. El National Center for Biotechnology Information ofrece, entre sus múltiples recursos, un visualizador de moléculas en 3D, donde se pueden explorar las proteínas hasta sus entrañas: desde la estructura primaria hasta la conformación (en algunos casos) supramolecular. ¿Gustas? Dale click al título de esta entrada, descarga el visualizador CN3D y busca tus proteínas favoritas (en inglés).

La No-Historia

¿Qué habría pasado si Cortés no hubiera conquistado al imperio azteca? ¿O si el grito de "los valientes no asesinan" de Guillermo Prieto hubiera tenido oídos sordos? ¿Y si los jesuitas no hubieran sido expulsados de la Nueva España? La historia contrafactual ofrece el recuento de lo-que-no-fue, la historia de lo posible. El número de Letras Libres de octubre dedica al reino de la Ucronía y presenta un conjunto de no-historias muy interesantes (www.letraslibres.com).

Al principio

¿Qué fue primero: el huevo o la gallina? Preguntas ociosas de este tipo pueden sacudir nuestra cabeza durante un rato, pero también puedan trasladarse a otros campos. Por ejemplo: ¿qué fue primero: el ADN o el ARN? Al parecer, ninguno. Según Stanley Miller y un par de colaboradores, la primer molécula genética fue un ancestro del ARN, llamado ácido péptido nucleico (PNA). He aquí el artículo completo.

El principio del reciclaje de la materia

Parafraseando a Lavoisier, resulta claro que la materia no se crea ni se destruye, sino que además de transformarse se la pasa dando vueltas. La biogeoquímica explica cómo circulan los elementos (como el carbono, nitrógeno, fósforo y azufre) y compuestos (como el agua). La Universidad de Colorado en Boulder incluye en su página web un recuento bastante amplio de las rutas y cantidades en que fluye la materia en nuestro planeta.     

El origen de la vida

Se han construido diversas teorías en torno al origen de la vida. Es claro que no podremos tener una certeza de cuál de estas teorías es la correcta, pero sí podemos tratar de explicar con la información disponible qué posibles rutas ha seguido la línea que va de los primeros elementos hasta la amplia diversidad de seres vivos. El artículo "Origen de la vida" en Wikipedia nos ofrece un panorama bastante amplio y nutrido acerca de estas posibilidades.

Presentación

Estimados visitantes:

En esta página encontrarán algunos materiales de apoyo para algunas de mis áreas de interés, incluyendo las experiencias educativas (cursos) que imparto en la Universidad Veracruzana, información ligada a proyectos de investigación o algunos otros temas relevantes.

Que les sea de provecho.